Common rail -suuttimen toiminta voidaan jakaa seuraaviin vaiheisiin:
Täyttövaihe: Korkeapaineinen{0}}polttoaine virtaa yhteispaineruiskun ohjauskammiosta työntämällä neulaventtiiliä ylöspäin ja puristaen palautusjousta. tässä vaiheessa suuttimen aukot pysyvät suljettuina.
Ruiskutusta edeltävä-vaihe: ECU lähettää lyhyen pulssisignaalin, joka aktivoi magneettiventtiilin. Ohjauskammiossa oleva polttoaine alentaa paineita virtaamalla paluukanavan läpi, jolloin neulaventtiili laskeutuu nopeasti paluujousen voimalla. Pieni määrä polttoainetta (noin 1–3 mm³) ruiskutetaan sylinteriin hyvin lyhyen ajan (0,1–0,3 ms) aikana, jolloin syntyy "pilotti sytytys", joka esi-lämmittää sylinterin ja luo suotuisat olosuhteet pääruiskutukselle.
Pääruiskutusvaihe: ECU pidentää magneettiventtiilin jännitteen kestoa, jolloin paine ohjauskammiossa laskee edelleen. Neulaventtiili avautuu kokonaan ja suuri määrä polttoainetta (vaihtelee kymmenistä satoihin mm³ käyttöolosuhteista riippuen) ruiskutetaan sylinteriin korkealla paineella (yli 200 MPa), jolloin muodostuu tasaisesti sumutettu polttoainesuihku, joka sekoittuu perusteellisesti palamisilmaan.
Ruiskutuksen jälkeinen-vaihe: Pääruiskutuksen päätyttyä ECU lähettää toisen lyhyen pulssisignaalin suorittaakseen pienen polttoainemäärän viivästetyn ruiskutuksen. Tämä alentaa pakokaasujen lämpötiloja (esim. EGR-järjestelmissä) tai helpottaa hiukkasten hapettumista (esim. DPF:n regeneroinnissa).
